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三、中国现代科学事业奠基人
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蔡元培被奉为学界领袖，除了他在教育事业方面所做的杰出贡献之外，还在于他同时也是中国现代科学事业的奠基人之一。
蔡元培本人虽然不是一名科学家，但他在年轻的时候就对科学有着浓厚兴趣，阅读了大量自然科学方面的书籍。
后来，蔡元培在致力教育事业活动中也特别重视大学教育，强调作为科学重要内容的学术研究是一个国家和民族跻身世界先进民族和世界强国之林的一个重要前提条件，指出“今中国积弱十倍于日、美，而科学之不发达，较昔日之日、美尤甚。
非我国子弟之资质，出于日、美之下也，实以学术幼稚，欲求高深，苦无道耳”
①。
他认为“在中国的教育发展中，可能还存在着其他的倾向，但是，最重要、最切望的乃是需要建立一所新的科学研究中心，这是需要特别加以强调的”
②。
1927年南京国民政府成立之后，蔡元培便以党国元老身份，极力倡导成立国家最高科研机关——中央研究院，以推动中国现代科学事业的发展，指出：“我族哲学思想，良不后人，而对于科学，则不能不自认落伍者。
……近年虽专研科学者与日俱增，而科学的方法，非仅仅应用于研究之学科而已，乃至一切事物，苟非凭借科学，明辨慎思，实地研究，详考博证，即有所得，亦为偶中；其失者无论矣。”
③“欧化优点即在事事以科学为基础；生活的改良，社会的改良，甚而至于艺术的创作，无不随科学的进步而进步。
故吾国不言新文化就罢了，果要发展新文化，尤不可不于科学的发展，特别注意。”
④他强调：“一个民族或国家要在世界上立得住脚，——而且要光荣的立住，——是要以学术为基础的。
尤其是，在这竞争剧烈的二十世纪，更要倚靠学术。
所以学术昌明的国家，没有不强盛的；反之，学术幼稚和知识蒙昧的民族，没有不贫弱的。
……我们以后要想雪去被人轻视的耻辱，恢复我们固有的光荣，只有从学术方面努力，提高我们的科学知识，更进一步对世界为一种新的贡献。”
①1928年4月23日，蔡元培欣然出任中央研究院院长，并先后辞去在政府中担任的许多要职，举家离开南京，定居上海，专心领导科学事业。
同年6月9日，蔡元培召集研究院各单位负责人在上海东亚酒楼举行第一次院务会议，宣告中央研究院正式成立，由此奠定了他在中国现代科学事业上的地位。
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