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科学家对上百种的限制性内切酶的特异性作了研究，搞清了它们在DNA长链上切断的精确位点，这样，这些酶就可以用来作为工具，根据科学家的意愿对DNA进行切割，所以这种限制性内切酶又被形象地称为“分子手术刀”
。
DNA连接酶是使DNA片段连接起来的催化剂。
它在DNA重组技术中，不仅要用限制性内切酶将需要的DNA片段切下来，而且还需要将它们与其他重要的DNA片段（如起着运载工具作用的质粒）连接起来，在这里就得用上DNA连接酶。
在DNA重组技术中，基因载体的应用是很重要的一个方面。
因为要使重组的DNA能够繁殖，必须使其进入宿主细胞（如某种细菌），但每种生物都是长期进化的产物，具有很强的排他性，异源DNA如果单独进入受体细胞，必然会遭到破坏。
因此，必须使用一种运载基因的载体作为媒介物，这种载体可以是质粒（一种较小的DNA），也可以是噬菌体。
有了上面的各种手段之后，基因工程就可以进行了。
应用基因工程生产药物
当人们需要生产某一种已知的蛋白质生物药物时，第一步是要取得决定这种蛋白质的基因片段，这可以用分离提取DNA的办法，也可以根据已知的顺序采用化学合成的方法，还可以利用以RNA为模板，以反转录酶催化。
取得A并进一步分离纯化。
第二步是对这段DNA装上“启动”
因子和终止密码，然后与质粒结合，形成重组的DNA。
第三步将重组的DNA送入寄主细胞中，通过对寄主细胞的培养（如对微生物进行发酵），这样就能取得基因工程的产物。
这种寄主细胞实际上是生产这种蛋白质药物的“工厂”
。
我们以胰岛素基因工程法生产为例，来说明这方面的创举。
胰岛素是目前世界上已知的最小的蛋白质，它由51个氨基酸组成，分为A、B两条链，通过两对二硫键连接。
胰岛素在体内起到降低血糖的作用，当人们体内血液中糖分升高时，胰岛素就能够促使血液中糖分转化为肝糖原，使糖分在肝脏中保存；当血液中糖分减少时，人体中另一种激素——胰高血糖素又能使肝糖原转化为血液中的糖分。
正是依靠这两种激素的调节，人体血液中的糖分才能一直处于最适中的状态。
当胰岛素缺乏时，血液中糖分增加，多余的糖分从尿液中排出体外，就会形成糖尿病。
糖尿病在晚期还会引起许多并发症。
目前，全世界患糖尿病的病人已超过了6000万人，是一种常见病。
为治疗糖尿病，需要给病人定期注射胰岛素。
这种生物药品过去从猪、牛的胰脏中提取，但动物胰脏的来源是有限的，特别由于胰脏中含有丰富的蛋白水解酶，在屠宰动物后如不立即将胰脏取出低温冷藏，胰岛素就会受到破坏。
自从有了基因重组的技术后。
科学家们就开始探索基因工程生产胰岛素的方法。
1978年9月，美国Geech公司和Lilly公司联合宣布人胰岛素在大肠杆菌中取得了成功，他们将胰岛素A链的基因和B链的基因分别与另一种称为PBR322的质粒连接，再转化到大肠杆菌K12中，分别培养含有这两种质粒的大肠杆菌，得到分别含有胰岛素A链和B链的产品，经过分离纯化，再将纯的A、B链重新组合，就得到了基因工程胰岛素。
临床实验证明，用基因工程方法生产的胰岛素与人胰岛素的结构完全相同（猪、牛胰岛素与人胰岛素存在少量氨基酸的不同，这种不同被称为种属差异），比动物来源的胰岛素作用快。
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